馬邊大風頂自然保護區位於四川盆地和雲貴高原的過渡地帶，東西寬15.3公裡，南北長37.0公裡，總面積30164公頃。區內有四條馬邊河的主要源頭溪流；最低海拔800米，最高海拔4042米，地勢陡峻，山高路險，平均坡度36°。保護區是以保護大熊貓及其生態環境為主的森林和野生動物類型自然保護區。由於保護區屬中亞熱帶季風濕潤氣候區，區內物種十分豐富，已知主要植物有51種132屬248種，屬國家一級保護的有珙桐，二級保護的有銀杏、篦子三尖杉等，己知主要陸棲脊椎動物有25目75科268種，屬國家一級保護的有大熊貓、四川山鷓鴣、牛羚等7種，二級保護的有小熊貓等28種。