廟島顯應宮位於廟島東北部，始建於宋徽宗宣和四年，長島漁民祖祖輩輩敬稱“海神娘娘”廟。明宗禎元年，崇禎皇帝御賜廟額“顯應宮”。
顯應宮大殿是全廟最大的建築，為硬山式結構，殿內媽祖坐像居正中神龕龍墩上，殿兩側有14尊站班，殿外兩側房內存有碑、碣、匾200余塊和歷史船模300余艘。後宮建築風格為歇山式，保留了明代的特點。宮內殿正位神台有銅鑄鍍金天後聖母像及2米高的九華青銅穿衣鏡一面，各種服飾用品及床帳、擺設應有盡有，黑臉媽祖也在顯應宮落戶，這裡常年香火不斷，每年的元宵節和娘娘生日，顯應宮便有萬余人朝拜。
媽祖廟之所以建於廟島，是因為廟島形若鳳凰，其身倍的燒餅島形如太陽，兩島相映，狀若“丹鳳朝陽”，屬上上風水寶地。在那裡還可以觀賞關帝廟、三元宮及我國第一座綜合性航海博物館等景點。